Unter den Antikern als Terra Atlantus bekannt, befand sich Atlantis ursprünglich auf der Erde. Als eine furchtbare Seuche die Milchstraßen -Galaxie heimsuchte, verschwanden die Antiker vor circa 5 bis 10 Millionen Jahren aus der Milchstraße und machten sich mit Atlantis zur Pegasus Galaxie auf. Es ist nicht bekannt ob Atlantis zu diesem Zweck auf der Erde gebaut wurde oder die Antiker die Stadt möglicherweise bereits nutzten als sie in die Milchstraße kamen. Beim Start von Atlantis blieb mindestens eine Antikerin Avjana allein auf der Erde mit einem kleinen Außenposten zurück, an der Stelle, wo sich einst die Stadt befand. Nachdem bei einer Mission von SG-1 ein Fehler auftauchte und das Stargate im SGC nicht angewählt werden konnte, sprang das Wurmloch auf das noch nicht bekannte Antarktis-Stargate um. Später wurde an dieser Stelle die Leiche von Ayiana gefunden, die jedoch wiederbelebt werden konnte . Nachdem sich O Neill zwei Jahre später das Wissen der Antiker ein zweites Mal in sein Gehirn geladen hatte, wurde auch der Außenposten wieder entdeckt
Wiederentdeckung der "Verlorenen Stadt"
Atlantis von der Seite betrachtet
Hinweise auf Atlantis wurden erstmals zu der Zeit entdeckt, als Daniel Jackson aufgestiegen war. Er übersetzte eine alte Steintafel mit Antiker-Schrift. Dort wurde von einer Stadt der Antiker erzählt, die vor Tausenden von Jahren versteckt werden musste, damit sie nicht in die Hände eines schrecklichen Feindes fiele. Ursprünglich wollte man die Stadt finden, um Anubis zu vernichten, jedoch war es SG-1 nicht möglich, die Stadt ausfindig zu machen, was aber durch die Entdeckung des Außenposten in der Antarktis und die darauffolgende Zerstörung von Anubis Flotte, vorerst nicht mehr nötig war.
Jedoch wurde die Suche weitergeführt und nach wochenlangen Forschungen gelang es Daniel Jackson endlich Atlantis zu finden. Er fand heraus, dass die Gate-Adresse von Atlantis aus acht Symbolen bestand, sich die Stadt also nicht in unserer Galaxie, sondern in einer kleineren, (3 Millionen Lichtjahre) von der Erde entfernten, Galaxie namens Pegasus befand. Durch die große Entfernung konnte man leider nur mit der Hilfe eines ZPm´s dorthin gelangen. Da sich die Rückkehr nach der Ankunft auf Atlantis als schwierig erweisen könnte, war man zunächst noch unschlüssig, ob man diesen großen Schritt wagen sollte. Doch die Neugier und das Interesse waren zu groß und so machte sich ein internationales Team aus Militärs und Wissenschaftlern auf, um die verlorene Stadt zu finden und zu erforschen.
Ankunft der Menschen der Erde auf Atlantis
Atlantis taucht auf
Nach der Ankunft auf Atlantis stellte das Team fest, dass die Sage der versunkenen Stadt Atlantis wahr war. Vor 10.000 Jahren wurden die Antiker von einem übermächtigen Feind vertrieben. Als letzte große Tat versenkten sie ihre Stadt als Sicherheitsmaßnahme in den Tiefen des Ozeans und als kein Ausweg mehr in Sicht war, flohen die restlichen Antiker zurück auf ihren alten Heimatplaneten - die Erde
Das Atlantis-Expedtionsteam steckte zunächst in einer schweren Krise. Da die ZPMs, die Atlantis mit Energie versorgen, fast aufgebraucht waren, stand die Stadt kurz davor, von den Wassermassen des Ozean überflutet zu werden. Als man evakuieren wollte, schaltete sich ein Sicherungsmechanismus ein — die Stadt erhob sich aus dem Wasser und stieg zur Oberfläche auf. Jedoch waren die ZPMs nun alle erschöpft, und somit gab es keine Möglichkeit die Schilde zu aktivieren. Hauptaufgabe des Teams war nun neben anderen Aktivitäten, Energiequellen zu finden, um Atlantis ausreichend mit Energie versorgen zu können.
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Zitate ~1~
Thor: Die Asgard würden niemals Waffen erfinden, die kleine Metallhülsen mit Kohlegemisch ausstoßen durch Zünden eines Pulvers aus Kalisalpeter, Holzkohle und Schwefel. (engl.: "...a weapon that propells small weights of iron and carbon alloys"; wörtlich etwa: eine Waffe, die kleine Gewichte aus Eisen-Kohlenstoff-Legierungen ausstößt)
Samantha Carter: ... Okay, schon kapiert.
(Daniel zu Vala auf der Prometheus):
Daniel:: Vala, nimm den Schal ab; das ist ein Militärschiff!
Vala:: Ich weiß, Schatz. Ich habe es schon mal gestohlen.
Zitate ~2~
Maybourne: Ich möchte alles verfügbare Personal auf diesem Stützpunkt zu meiner Verfügung haben, und das bereits gestern!
O'Neill: Sie dürfen sich gerne beteiligen, aber ich leite diese Aktion.
Maybourne: Ich bin immer noch dafür verantwortlich.
O'Neill: Oh, ich mach' Sie schon dafür verantwortlich, Maybourne, verlassen Sie sich darauf. Aber das ist eine Stargate-Einheit, und ich habe hier das Sagen. Wenn Sie ein Problem damit haben, besprechen Sie es mit Hammond.
Maybourne: Das werde ich. (steht auf und will gehen, O'Neill steht ihm im Weg.) Einen Offizier zu schlagen ist der schnellste Weg zum Militärgericht.
O'Neill: Ich will Sie doch nicht schlagen, Maybourne. Ich werde sie erschießen.
Herak: Ich spreche mit meinem Gebieter!
O'Neill: Ja, tu das! Vergiss nicht ihm zu sagen, dass du mist gebaut hast.
Jonas: Ist es denn wirklich nötig ihn noch weiter zu provozieren?
O'Neill:Ja!
O'Neill: Wir haben einen Film mitgebracht
Teal'c: "Star Wars."
O'Neill: Er hat ihn wie oft, acht ...?
Teal'c: Neun.
O'Neill: Neun mal gesehn. Und wenn Teal'c ihn super findet, muss er gut sein.
Carter: Sie haben noch nie "Star Wars" gesehn?
O'Neill: Naja, Sie wissen ja, ich und Science-Fiction.
Sam erzählt von den Systemlords, dass sie sich auf verlassenen Planeten verstecken wollen.
Jack: Und das betrifft uns inwiefern?
Daniel: Auf einem dieser Planeten der zum System von Lord Ares gehörte, haben die Tok'ra einen gewissen Harry Maybourne verbannt.
Jack: Und das betrifft uns inwiefern?
Zitate ~3~
O'Neill: Haben sie etwas Angst?
Carter: Ja Sir, habe ich!
O'Neill: Hören sie gefälligst auf damit!^^
O'Neill: Verdammt
Teal´c: Was ist ?
O'Neill: Ich habe vergessen die Simpsons aufzunehmen....das ist mir verdammt wichtig!